Bionano Genomics, Inc. gab die Veröffentlichung einer Studie bekannt, in der mittels optischer Genomkartierung (OGM) numerische und strukturelle Veränderungen an zwei induzierten pluripotenten Stammzelllinien (iPSC), WTC-11 und Tuba1-GFP, während der Langzeitkultivierung untersucht wurden. Diese Forschung liefert wissenschaftliche und praktische Unterstützung für den Einsatz von OGM-Workflows in der regenerativen Medizin, da OGM in der Lage ist, Hunderte von strukturellen Varianten (SVs) zu erkennen, von denen viele mit anderen zytogenetischen Methoden nicht erkannt wurden und die die genomische Integrität von iPSCs beeinträchtigen können. iPSCs haben das Potenzial, eine größere klinische Wirkung auf Patienten zu haben als Stammzellen und gleichzeitig eine mögliche immunologische Abstoßung zu vermeiden, da sie von dem zu behandelnden Patienten stammen können.

Um für das Gene Editing verwendet werden zu können, müssen iPSCs in Kultur erzeugt und expandiert werden, was die Möglichkeit eröffnet, dass sich im Laufe der Zeit Chromosomenvarianten ansammeln. In der Studie, die in der Zeitschrift Genes veröffentlicht wurde, verfolgten die Autoren zwei Zelllinien über 150 Tage kontinuierlicher Kultur, d.h. 50 Passagen, und fanden bei beiden signifikante Veränderungen des Genoms durch OGM. Darüber hinaus wurden in beiden Zelllinien Hunderte von SVs beobachtet, die in der internen Kontrolldatenbank nicht gefunden wurden und sich im Laufe der Studie ansammelten, was sich möglicherweise auf die Genexpression und das Überleben der Zellen auswirkte.

Die Autoren schlagen außerdem vor, dass aufgrund der Akkumulation von Chromosomenveränderungen im Laufe der Zeit und der unbekannten Auswirkungen auf iPSCs in der Therapie die Kulturzeiten begrenzt werden sollten.