Singular Genomics Systems, Inc. arbeitet mit NVIDIA zusammen, um marktführende Sequenzier- und Analysegeschwindigkeiten der nächsten Generation zu erreichen
Am 10. Mai 2022 um 22:01 Uhr
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Singular Genomics Systems, Inc. gab bekannt, dass das Unternehmen mit NVIDIA zusammenarbeitet, um die Leistung der G4 Sequenzierplattform mit NVIDIA Clara Parabricks für Sekundäranalysen einschließlich Alignment und Variantenaufruf mit über 50 Tools für Keimbahn- und somatische Arbeitsabläufe zu validieren und zu optimieren. Diese Zusammenarbeit wird Forschern und Klinikern, die das G4 Instrument der nächsten Generation von Singular verwenden, den Zugang zu Clara Parabricks ermöglichen. Damit können Anwender beschleunigte Bioinformatik-Pipelines für wichtige Anwendungen wie die Sequenzierung ganzer Genome, die Exom-Sequenzierung, die RNA-Sequenzierung (RNA-Seq) und gezielte Gen-Panels ausführen. Diese Lösung wird den Kunden nahtlos über die Amazon Web Services Cloud-Implementierung oder über lokale Server mit NVIDIA-GPUs zur Verfügung stehen.
Die Technologie von NVIDIA wird in der gesamten Genomik eingesetzt, um traditionelle und Deep-Learning-Analysen sowohl innerhalb als auch außerhalb des Instruments für primäre, sekundäre und tertiäre genomische Analysen zu beschleunigen. Die G4 Sequenzierungsplattform nutzt den NVIDIA RTX A6000 für KI-gestütztes Basecalling. Mit dieser Ankündigung wird die Zusammenarbeit auf nachgelagerte Workflows ausgeweitet.
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Singular Genomics Systems, Inc. ist ein biowissenschaftliches Technologieunternehmen, das Technologien für die Sequenzierung der nächsten Generation (NGS) und Multiomics entwickelt. Das Unternehmen hat eine NGS-Technologie (Sequencing Engine) entwickelt, die eine Plattformtechnologie für seine Produkte darstellt. Der Kern der Sequencing Engine besteht aus proprietärer Chemie, einschließlich neuartiger chemischer Verbindungen, Polymere und Enzyme. Die aktive Produktentwicklungspipeline des Unternehmens besteht aus zwei Produkten, die jeweils die Sequencing Engine nutzen und speziell für unterschiedliche Anwendungen entwickelt wurden. Das erste Produkt, die G4 Sequencing Platform (G4), zielt auf den NGS-Markt ab. Das zweite in der Entwicklung befindliche Produkt, der G4X Spatial Sequencer, nutzt die Sequenzierungstechnologie des Unternehmens und wendet sie als In-situ-Readout für Transkriptomik, Proteomik und fluoreszierendes H&E in Gewebe an, mit räumlichem Kontext und auf der gleichen Plattform wie der G4. Das Unternehmen ist auch mit der Entwicklung von PX beschäftigt, einer Multiomics-Plattform im Entwicklungsstadium.
Singular Genomics Systems, Inc. arbeitet mit NVIDIA zusammen, um marktführende Sequenzier- und Analysegeschwindigkeiten der nächsten Generation zu erreichen