10x Genomics, Inc. gab die ersten kommerziellen Lieferungen seiner Xenium-Plattform für die In-situ-Analyse bekannt. Xenium ist die nächste Generation der gezielten räumlichen Profilierung von Genen und Proteinen mit subzellulärer Auflösung. Die Plattform umfasst ein vielseitiges und einfach zu bedienendes Gerät, ein vielfältiges Menü kuratierter, anpassbarer und hochwertiger Panels und Xenium Explorer, eine intuitive Software für die interaktive Datenvisualisierung.

Dank seiner branchenführenden Geschwindigkeit und seines Durchsatzes ermöglicht Xenium das subzelluläre Mapping von Hunderten von RNA-Targets und generiert qualitativ hochwertige Daten mit hoher Sensitivität und Spezifität, die neue Einblicke in die Struktur und Funktion von Zellen ermöglichen. Die Sequenzierung der nächsten Generation und die Bildgebung haben dramatische Daten hervorgebracht und die Auflösung von Zellen in Aktion verfeinert, aber beide Bereiche haben sich separat entwickelt. Die hohe zelluläre Auflösung der Xenium-Plattform ermöglicht es Forschern, die Beziehung zwischen zellulärer Struktur und Funktion direkt im Gewebe zu beurteilen, ohne dass eine Sequenzierung erforderlich ist, wodurch eine Brücke zwischen Genomik und Pathologie geschlagen wird.

Zu den wichtigsten Merkmalen der Xenium-Plattform gehören: Erstklassige Geschwindigkeit und Durchsatz. Xenium verfügt über eine sehr große abbildbare Fläche und ist das In-SiSitu-Instrument mit dem höchsten Durchsatz in seiner Klasse. Mit Xenium können Forscher in kürzester Zeit die größte Gewebefläche mit Einzelmolekülauflösung analysieren.

Breites Menü an Genpanels. Die Xenium-Plattform bietet ein vielfältiges Menü definierter, validierter, biologisch relevanter Inhalte mit der Möglichkeit, eine große Anzahl von benutzerdefinierten Genen hinzuzufügen. Mit der Markteinführung des Xenium Analyzers führt 10x Genomics zwei zielgerichtete Panels ein, die mit einem breiten Spektrum an frisch gefrorenen und FFPE-Proben kompatibel sind und für spezifische Forschungsfragen angepasst werden können.

10x Genomics rechnet damit, im Jahr 2023 weitere Panels einzuführen, die speziell auf Gewebetypen und Anwendungen zugeschnitten sind. Kompatibilität mit Standard-Pathologie, einschließlich H&E. Xenium ist so konzipiert, dass die Gewebemorphologie intakt bleibt. Dies ermöglicht zusätzliche Erkenntnisse aus demselben Gewebeschnitt nach dem Lauf, so dass die Forscher die Korrespondenzen zwischen den molekularen Daten und den morphologischen Bildern untersuchen können.

Umfassende Onboard-Analyse. Xenium bietet die Analyse von Primär- und Sekundärdaten auf dem Gerät, einschließlich der Zellsegmentierung, parallel zum Gerätelauf. Dies ermöglicht eine direkte Untersuchung der Daten ohne weitere Verarbeitung außerhalb des Instruments, wodurch die Zeit bis zum Ergebnis verkürzt und die Rechenlast für den Kunden erheblich reduziert wird.

Xenium Explorer, die interaktive Visualisierungssoftware. Heute stellte das Unternehmen außerdem Xenium Explorer vor, seine benutzerfreundliche Desktop-Software für die interaktive Exploration und Datenanalyse. Xenium Explorer nutzt den explorationsbereiten Output der Plattform, um Forschern die Möglichkeit zu geben, Ergebnisse auf subzellulärer und Gewebeebene sofort zu sehen.

Mit Xenium haben Forscher auch die Flexibilität, Standardformate für Einzelzellen und neue offene Standarddatenausgaben mit von der Community entwickelten Analysetools zu verwenden.